太醫之用水來源皆為台灣自來水公司，在現今極端氣候影響之下，旱季越來越長。為降低缺水風險，在符合法令及園區規範之前提下，太醫結合冷凝水回收、中水接管、提高冷卻水塔循環倍率、製程水循環使用等措施，大幅減少整體用水量。截至2025年為止，用水回收率均維持在70％以上。
此外，為避免廢水對社區環境造成衝擊，太醫已設置廢水處理監控系統，管控廢污水之水質水量，並每半年委由合格檢測廠商進行廢污水水質檢測及依規定申報。2025年太醫所排放之廢水皆符合科學園區納管排放標準。
此外，為避免廢水對社區環境造成衝擊，太醫已設置廢水處理監控系統，管控廢污水之水質水量，並每半年委由合格檢測廠商進行廢污水水質檢測及依規定申報。2025年太醫所排放之廢水皆符合科學園區納管排放標準。
用水/排水量統計表
單位：公噸
| 資料範圍 | 本公司 | ||
|---|---|---|---|
| 年度 | 2023年 | 2024年 | 2025年 |
| 自來水用水量（取水量） | 57,619.10 | 57403.90 | 57,509.96 |
| 中水用水量 | 9,593.00 | 9,811.00 | 5,311.00 |
| 總用水量 | 67,212.10 | 67,214.90 | 62,820.96 |
| 自來水用水密集度(噸/仟元) | 0.02483 | 0.02448 | 0.02390 |
| 廢污水排放量 | 36,625.90 | 34,532.80 | 32,069.00 |
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